Als Pokémon lebst du im friedlichen Ruhenau. Doch schon bald machst du dich mit deinem Pokémon-Partner auf den Weg zum Pokémon-Forscherteam, einer Gruppe, die es sich zur Aufgabe gemacht hat, die Welt zu erkunden und zu kartieren. Ihr schließt euch dem Team an und beginnt mit der Erkundung Mysteriöser Dungeons voller Pokémon. Doch Dungeons sind gefährliche Orte. Dort erwarten dich Fallen, landschaftliche Besonderheiten wie Seen oder Flüsse und natürlich neue Pokémon. Wer diese Dungeons meistert, wird jedoch reichlich belohnt. Aber wenn du in Ohnmacht fällst, musst du unter Umständen zum Eingang des Dungeons zurück und verliest dabei Items und Geld. Außerdem sind diese Dungeons immer anders: Von der Struktur bis zu den Fundstellen von Pokémon wird jedes Mal alles willkürlich festgelegt, wenn du einen Dungeon betrittst. Beim Erkunden jedes Stockwerks baut sich automatisch eine Karte auf, damit du weißt, ob du einem Weg schon einmal gefolgt bist. In Pokémon Mystery Dungeon-Spielen passiert